ক. জুনিয়র জামায়াত সমূহে (শিশু শ্রেণী-অষ্ট শ্রেণি) ভর্তির জন্যে ডিসেম্বর মাসের প্রথম সপ্তাহ থেকে ভর্তি পরীক্ষার ফরম বিতরণ করা হয়। অতঃপর ডিসেম্বর মাসের শেষ সপ্তাহে নির্ধারিত তারিখে ভর্তি পরীক্ষায় (লিখিত ও মৌখিক) উত্তীর্ণ হওয়া সাপেক্ষে ভর্তি করা হয়। আর নবম শ্রেণির ছাত্রদের জন্য JDC এবং এর ফল প্রকাশের পরে জানুয়ারীর প্রথম সপ্তাহে ভর্তি পরীক্ষা নিয়ে শূন্য আসনের বিপরীতে ছাত্র ভর্তি করা হয়।

খ. আলিম শ্রেণীতে বাংলাদেশ মাদরাসা শিক্ষা বোর্ড এবং ফাযিল (পাস ও অনার্স) ও কামিল শ্রেণীতে ইসলামী বিশ্ববিদ্যালয়, কুষ্টিয়া ও ইসলামি আরবি বিশ্ববিদ্যালয়ের প্রকাশিত বিজ্ঞপ্তি মোতাবেক শিক্ষার্থী ভর্তি করা হয়।

মহিলা শাখার ভর্তির সময় মূল শাখার অনুরূপ।

দারুননাজাত সিদ্দীকিয়া কামিল মাদরাসার বিশেষ বিভাগ তাখসীসি শাখা নামে পরিচিত। এ শাখায় ভর্তির সময় নিম্নরূপ: ক. প্রাক তাখসীসি: শর্টকোর্সের মাধ্যমে ১ বছরে অষ্টম শ্রেণির উপযোগী করে গড়ে তোলার জন্য এ জামাত। প্রতি বছর জানুয়ারী মাসে ও রমজানের পরে এ শাখায় ভর্তি নেয়া হয়।

খ. তাখসীসি ৮ম ও ৯ম শ্রেণিতে মূল শাখার জন্য নির্ধারিত সময়ে ভর্তি করা হয়।

গ. তাখসীসি আলিম শ্রেণিতে দাখিল পরীক্ষার পরপর ভর্তি করা হয়।

ঘ. তাখসীসি মুতাফাররিকা জামাতে আলিম পরীক্ষার পরপরই ভর্তি করা হয়।

প্রতি বছর রমজান মাসের পর ১৫ শাওয়ালের মধ্যে ছাত্র আসন খালি থাকা সাপেক্ষে পরীক্ষা নিয়ে ভর্তি পরীক্ষায় উত্তীর্ণ ছাত্রদেরকে ভর্তি করা হয়। ভর্তির সময়, বয়স ও মেধা বিবেচনা করা হয়।

নাজেরা সর্বোচ্চ ৭ (সাত) বছর এবং হিফজ সর্বোচ্চ ১২ (বার) বছর।

সাদা কাপড়ের নেছফছাক গোল জামা, পাজামা ও গোল টুপি।

(প্রত্যেক ছাত্রের জন্য পাগড়ী, মুসল্লা ও মেসওয়াক বাধ্যতামূলক)